Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWC2Q2TAL6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms