Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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NDUFA9Q16795 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDUFA9Q16795 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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