Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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