Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B3Q15393 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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