Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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IRF4Q15306 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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IRF4Q15306 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF4Q15306 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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