Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NECTIN1Q15223 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
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