Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms