Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIN2CQ14957 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIN2CQ14957 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms