Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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COL4A6Q14031 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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