Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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