Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDH18Q13634 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH18Q13634 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms