Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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