Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms