Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
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