Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPM6BQ13491 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPM6BQ13491 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms