Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD4Q13485 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD4Q13485 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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