Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MSLNQ13421 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSLNQ13421 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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