Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SELENBP1Q13228 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms