Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PAPPAQ13219 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
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PAPPAQ13219 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
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