Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RLFQ13129 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLFQ13129 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLFQ13129 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLFQ13129 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLFQ13129 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLFQ13129 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLFQ13129 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLFQ13129 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLFQ13129 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLFQ13129 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLFQ13129 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLFQ13129 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLFQ13129 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLFQ13129 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLFQ13129 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLFQ13129 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLFQ13129 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLFQ13129 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLFQ13129 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLFQ13129 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLFQ13129 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLFQ13129 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RLFQ13129 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLFQ13129 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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