Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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