Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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