Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP3Q12983 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP3Q12983 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms