Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC10A2Q12908 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms