Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFSWAPQ12872 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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