Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 SWF1YDR126W 1011 nt2.36□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 GPI8YDR331W 1236 nt2.36□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 LAG1YHL003C 1236 nt2.36□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 TPM2YIL138C 486 nt2.36□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 CMS1YLR003C 876 nt2.36□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 TEN1YLR010C 483 nt2.36□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 TSC3YBR058C-A 243 nt2.36□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 TRA1YHR099W 11235 nt2.36□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 EDS1YBR033W 2760 nt2.36□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 GIS1YDR096W 2685 nt2.35□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 CLN3YAL040C 1743 nt2.35□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YRB1YDR002W 606 nt2.35□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YGL165CYGL165C 579 nt2.35□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 URA10YMR271C 684 nt2.35□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 RPB11YOL005C 363 nt2.35□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YOR392WYOR392W 444 nt2.35□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 PUT3YKL015W 2940 nt2.35□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 INO80YGL150C 4470 nt2.35□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 MDM32YOR147W 1869 nt2.35□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 GUP1YGL084C 1683 nt2.34□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YEF3YLR249W 3135 nt2.34□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.34□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 HYP2YEL034W 474 nt2.34□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 PEP8YJL053W 1140 nt2.34□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YKL111CYKL111C 336 nt2.34□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YAR047CYAR047C 321 nt2.34□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 RPL25YOL127W 429 nt2.34□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YBR285WYBR285W 435 nt2.34□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YCL023CYCL023C 348 nt2.34□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 PSD2YGR170W 3417 nt2.34□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 BNR1YIL159W 4128 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YFH1YDL120W 525 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 CAJ1YER048C 1176 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 UTP30YKR060W 825 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 PAU8YAL068C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 RPS7BYNL096C 573 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 PAU20YOL161C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YOR029WYOR029W 336 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YOR053WYOR053W 342 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YBR277CYBR277C 402 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 PHO2YDL106C 1680 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 NDD1YOR372C 1665 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 TUS1YLR425W 3924 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 VPS13YLL040C 9435 nt2.33□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YPR097WYPR097W 3222 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 MRP10YDL045W-A 288 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 GCN4YEL009C 846 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 BRP1YGL007W 378 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 RPC10YHR143W-A 213 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YIL058WYIL058W 285 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 PET191YJR034W 327 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 RPS22BYLR367W 393 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 TFC3YAL001C 3483 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 UTP22YGR090W 3714 nt2.32□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 DAS1YJL149W 1992 nt2.31□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YFR056CYFR056C 369 nt2.31□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.31□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 HYR1YIR037W 492 nt2.31□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 TIM8YJR135W-A 264 nt2.31□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 IRC19YLL033W 693 nt2.31□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.31□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YAR068WYAR068W 486 nt2.31□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 PEX17YNL214W 600 nt2.31□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 SLM6YBR266C 453 nt2.31□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 MLH1YMR167W 2310 nt2.31□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 SSY1YDR160W 2559 nt2.3□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 TIM9YEL020W-A 264 nt2.3□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YGR025WYGR025W 303 nt2.3□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 RRF1YHR038W 693 nt2.3□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.3□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 RAM2YKL019W 951 nt2.3□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YLR458WYLR458W 381 nt2.3□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YBR012CYBR012C 420 nt2.3□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 RUD3YOR216C 1455 nt2.3□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 ALK2YBL009W 2031 nt2.3□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 STH1YIL126W 4080 nt2.3□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 MMS22YLR320W 4365 nt2.29□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.29□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 snR13snR13 124 nt2.29□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 UBP15YMR304W 3693 nt2.29□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 NIC96YFR002W 2520 nt2.29□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 ATG31YDR022C 591 nt2.28□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YAP6YDR259C 1152 nt2.28□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 ATP17YDR377W 306 nt2.28□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.28□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 ZEO1YOL109W 342 nt2.28□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 YPR039WYPR039W 336 nt2.28□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 MGR1YCL044C 1254 nt2.28□□□□□ -2.04
CTF3Q12748 UBP11YKR098C 2154 nt2.27□□□□□ -2.05
CTF3Q12748 FMP16YDR070C 282 nt2.27□□□□□ -2.05
CTF3Q12748 VOA1YGR106C 798 nt2.27□□□□□ -2.05
CTF3Q12748 RPL40AYIL148W 387 nt2.27□□□□□ -2.05
CTF3Q12748 SHE2YKL130C 741 nt2.27□□□□□ -2.05
CTF3Q12748 YLR255CYLR255C 354 nt2.27□□□□□ -2.05
CTF3Q12748 RPS17AYML024W 411 nt2.27□□□□□ -2.05
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