Protein–RNA interactions for Protein: Q12069

PUS9, tRNA pseudouridine(32) synthase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS9Q12069 MET10YFR030W 3108 nt3.05□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 MYO5YMR109W 3660 nt3.05□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 FAR1YJL157C 2493 nt3.04□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 YEL025CYEL025C 3567 nt3.04□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 FRE8YLR047C 2061 nt3.04□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 POL3YDL102W 3294 nt3.04□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 TSA2YDR453C 591 nt3.04□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 YBL053WYBL053W 375 nt3.04□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 YMR321CYMR321C 318 nt3.04□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 YPR053CYPR053C 456 nt3.04□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 JJJ2YJL162C 1752 nt3.04□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 RRM3YHR031C 2172 nt3.04□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 CHO2YGR157W 2610 nt3.04□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 REG1YDR028C 3045 nt3.03□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 MSH2YOL090W 2895 nt3.03□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt3.03□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 MNT3YIL014W 1893 nt3.03□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 VTC4YJL012C 2166 nt3.03□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 SMT3YDR510W 306 nt3.03□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 ISU1YPL135W 498 nt3.03□□□□□ -1.92
PUS9Q12069 CUL3YGR003W 2235 nt3.03□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 SSY1YDR160W 2559 nt3.03□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 RED1YLR263W 2484 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 MIT1YEL007W 2001 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 MSS11YMR164C 2277 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YGL217CYGL217C 342 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 TIM13YGR181W 318 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YHL041WYHL041W 450 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 NCE101YJL205C 162 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 RPS21AYKR057W 264 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 CCW14YLR390W-A 717 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YPL182CYPL182C 384 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YBR224WYBR224W 516 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 KAP104YBR017C 2757 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 RPA190YOR341W 4995 nt3.02□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 RCY1YJL204C 2523 nt3.01□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 NTO1YPR031W 2247 nt3.01□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 VAS1YGR094W 3315 nt3.01□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 HPA3YEL066W 540 nt3.01□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 SRL3YKR091W 741 nt3.01□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 PCC1YKR095W-A 267 nt3.01□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 GIS2YNL255C 462 nt3.01□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YOR015WYOR015W 360 nt3.01□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 SAR1YPL218W 573 nt3.01□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 TRZ1YKR079C 2517 nt3.01□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 CIN1YOR349W 3045 nt3.01□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 BIT61YJL058C 1632 nt3.01□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 NOP4YPL043W 2058 nt3□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 GCN1YGL195W 8019 nt3□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 STE6YKL209C 3873 nt3□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YDL041WYDL041W 354 nt3□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 AIM11YER093C-A 414 nt3□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 RPL36AYMR194W 303 nt3□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YPR063CYPR063C 423 nt3□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 snR52snR52 92 nt3□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YOR296WYOR296W 3870 nt3□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 STT4YLR305C 5703 nt3□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YDL176WYDL176W 2127 nt2.99□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 CWC22YGR278W 1734 nt2.99□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 SMC2YFR031C 3513 nt2.99□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 PDC2YDR081C 2778 nt2.99□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 FAA2YER015W 2235 nt2.99□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 NUP82YJL061W 2142 nt2.98□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 snR79snR79 84 nt2.98□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YDR193WYDR193W 399 nt2.98□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 DYN2YDR424C 279 nt2.98□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.98□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YNL028WYNL028W 318 nt2.98□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 HHT1YBR010W 411 nt2.98□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 TRM7YBR061C 933 nt2.98□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YAT2YER024W 2772 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YGR250CYGR250C 2346 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 PHD1YKL043W 1101 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 RPS18BYML026C 441 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 YPR146CYPR146C 330 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 UBP5YER144C 2418 nt2.97□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 MUS81YDR386W 1899 nt2.96□□□□□ -1.93
PUS9Q12069 HDA3YPR179C 1968 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 ARK1YNL020C 1917 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 DUF1YOL087C 3351 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YSP2YDR326C 4317 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YLL007CYLL007C 1998 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 CDC24YAL041W 2565 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 SSE1YPL106C 2082 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 VPS64YDR200C 1815 nt2.96□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YPK1YKL126W 2043 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 TSC11YER093C 4293 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 GYP7YDL234C 2241 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 MDM1YML104C 3384 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 VPS3YDR495C 3036 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YIL166CYIL166C 1629 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 SMD1YGR074W 441 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 RRT15YLR162W-A 189 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 CSE2YNR010W 450 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 FLO1YAR050W 4614 nt2.95□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 DBP10YDL031W 2988 nt2.94□□□□□ -1.94
PUS9Q12069 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms