Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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