Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIPAL4Q0D2K0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms