Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFFO1Q0D2I5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms