Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NCBP1Q09161 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms