Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms