Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC1Q08554 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC1Q08554 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms