Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms