Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms