Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms