Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKCDQ05655 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms