Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	YBR012W-B	YBR012W-B	5271 nt		3.2	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YOR142W-B	YOR142W-B	5268 nt		3.2	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YPL257W-B	YPL257W-B	5268 nt		3.2	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YPR158W-B	YPR158W-B	5271 nt		3.2	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YBL065W	YBL065W	345 nt		3.2	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	RGA2	YDR379W	3030 nt		3.19	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	SAK1	YER129W	3429 nt		3.19	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	RPL14B	YHL001W	417 nt		3.19	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YJL202C	YJL202C	348 nt		3.19	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	RPL40B	YKR094C	387 nt		3.19	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	NCL1	YBL024W	2055 nt		3.19	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	PDR1	YGL013C	3207 nt		3.19	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	SGS1	YMR190C	4344 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	CDC24	YAL041W	2565 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	UBP11	YKR098C	2154 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YJR003C	YJR003C	1560 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YDL025W-A	YDL025W-A	105 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	DLS1	YJL065C	504 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	RPS22A	YJL190C	393 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	RPL36A	YMR194W	303 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YSY6	YBR162W-A	198 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YER023C-A	YER023C-A	213 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YFR056C	YFR056C	369 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YNL146W	YNL146W	303 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	SNU114	YKL173W	3027 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	TAO3	YIL129C	7131 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YER121W	YER121W	345 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	FCF2	YLR051C	654 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	TMA10	YLR327C	261 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YML009C-A	YML009C-A	327 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	REV1	YOR346W	2958 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YLR278C	YLR278C	4026 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	IPT1	YDR072C	1584 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	RTT10	YPL183C	3042 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	KAP104	YBR017C	2757 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	INP52	YNL106C	3552 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	YJL070C	YJL070C	2667 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	MPH1	YIR002C	2982 nt		3.15	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	ESL2	YKR096W	3588 nt		3.15	□□□□□ -1.9
NSE3	Q05541	HRD3	YLR207W	2502 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	FMP16	YDR070C	282 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	VTI1	YMR197C	654 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YMR324C	YMR324C	243 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	RPL9B	YNL067W	576 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	LSM7	YNL147W	348 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YOR050C	YOR050C	348 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YBT1	YLL048C	4986 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	RLI1	YDR091C	1827 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YEL057C	YEL057C	702 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	PNC1	YGL037C	651 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	PAU14	YIL176C	363 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	PAU1	YJL223C	363 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YKL136W	YKL136W	399 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	SEC7	YDR170C	6030 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YJR098C	YJR098C	1971 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YPL182C	YPL182C	384 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	TOM1	YDR457W	9807 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	NFT1	YKR103W	3657 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	MOT1	YPL082C	5604 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	INP53	YOR109W	3324 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	VPS16	YPL045W	2397 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	GEA1	YJR031C	4227 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	LSO2	YGR169C-A	279 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YAL042C-A	YAL042C-A	378 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	UTP30	YKR060W	825 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	GRX8	YLR364W	330 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	CGI121	YML036W	546 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YPR016W-A	YPR016W-A	261 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YPR146C	YPR146C	330 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	NAN1	YPL126W	2691 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	RPN1	YHR027C	2982 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	KAR3	YPR141C	2190 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	ACB1	YGR037C	264 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YHR052W-A	YHR052W-A	195 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YHR054W-A	YHR054W-A	195 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	VTC3	YPL019C	2508 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	SUL1	YBR294W	2580 nt		3.1	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	SHE2	YKL130C	741 nt		3.1	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	SWT1	YOR166C	1377 nt		3.1	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	CDC20	YGL116W	1833 nt		3.09	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	RRP12	YPL012W	3687 nt		3.09	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	HOS4	YIL112W	3252 nt		3.09	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	JSN1	YJR091C	3276 nt		3.09	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	YDL011C	YDL011C	324 nt		3.09	□□□□□ -1.91
NSE3	Q05541	AMS1	YGL156W	3252 nt		3.09	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	PRK1	YIL095W	2433 nt		3.09	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	OSW7	YFR039C	1533 nt		3.09	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	SDC1	YDR469W	528 nt		3.08	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	YGL024W	YGL024W	336 nt		3.08	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	BIL1	YOR304C-A	231 nt		3.08	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	RTC6	YPL183W-A	282 nt		3.08	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	INP51	YIL002C	2841 nt		3.08	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	SOK2	YMR016C	2358 nt		3.08	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	NUM1	YDR150W	8247 nt		3.07	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	YGR050C	YGR050C	357 nt		3.07	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	MSL1	YIR009W	336 nt		3.07	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	YPR203W	YPR203W	309 nt		3.07	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	SGD1	YLR336C	2700 nt		3.07	□□□□□ -1.92
NSE3	Q05541	NUP120	YKL057C	3114 nt		3.07	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms