Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms