Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID5AQ03989 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID5AQ03989 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms