Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms