Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF8Q02556 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF8Q02556 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms