Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms