Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms