Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms