Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms