Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELNP78509 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELNP78509 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RELNP78509 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RELNP78509 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELNP78509 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELNP78509 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELNP78509 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELNP78509 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELNP78509 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELNP78509 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELNP78509 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELNP78509 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELNP78509 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RELNP78509 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELNP78509 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELNP78509 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELNP78509 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms