Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX6P78412 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX6P78412 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX6P78412 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX6P78412 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IRX6P78412 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IRX6P78412 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX6P78412 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX6P78412 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX6P78412 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX6P78412 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX6P78412 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX6P78412 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX6P78412 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX6P78412 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX6P78412 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX6P78412 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX6P78412 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms