Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP2P63027 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP2P63027 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms