Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VBP1P61758 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VBP1P61758 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VBP1P61758 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
VBP1P61758 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms